また、血糖自己測定器の血糖値を算出する方法が機種によって異なるものもあります。
一般に血糖値は静脈血、末梢血、動脈血で異なります。静脈血で110mg/dLであった血糖は末梢血であれば130mg/dL、動脈血であれば150mg/dL程度となります。血糖自己測定は末梢血で測定しますが、病院で測定する血糖値は静脈血で測定するため、ずれが生じます。

国際標準化機構(ISO)では血糖自己測定器は、末梢血の血糖値として表示するように公表されており、ほとんどの血糖自己測定器の血糖値は末梢血として表示されていますが、外来で静脈採血した血糖の値とずれが生じないよう静脈血換算を行い血糖値表示している機種もあります。そのため、同じ血液で血糖を測定しても機種によりずれが生じるものがあります。